Gia quyến Nguyễn_Phúc_Nguyên

Sãi vương Nguyễn Phúc Nguyên có mười hai công tử và bốn công nữ:[37]

Vợ

Con trai

  1. Khánh Quận công Nguyễn Phúc Kỳ (? - 27 tháng 7 năm 1631). Ban đầu làm Chưởng cơ, sau giữ chức Hữu phủ Chưởng phủ sự, trấn thủ Quảng Nam. Lúc còn sống thường thi hành ân đức, cấp dưỡng quân dân nên khi mất sĩ dân đều thương tiếc. Có bốn con trai đều làm đến chức Chưởng dinh.
  2. Nguyễn Phúc Lan: Người kế vị Nguyễn Phúc Nguyên, gọi là Chúa Thượng
  3. Nguyễn Phúc Anh, trấn thủ Quảng Nam. Mưu phản nên bị chú ruột là Tường Quận công Nguyễn Phúc Khê giết đi và tước tông tịch.
  4. Chưởng dinh Nguyễn Phúc Trung, em cùng mẹ với chúa Thượng. Nghe lời Tống thị (vợ của Khánh Quận công) mà phản nghịch, bị giết và tước tông tịch.
  5. Nguyễn Phúc An, em cùng mẹ với chúa Thượng. Mất sớm, không rõ truyện.
  6. Đô đốc Hữu phủ Quận công Nguyễn Phúc Vĩnh, có bảy con trai.
  7. Nguyễn Phúc Lộc, không có truyện.
  8. Phó tướng Nguyễn Phúc Tứ, trấn thủ Quảng Nam. Lúc Tôn thất Anh làm phản, ông không theo nên thoát tội.
  9. Nguyễn Phúc Thiệu, không có truyện.
  10. Vinh Quận công Nguyễn Phúc Vinh, làm tới chức Chưởng cơ. Sau khi qua đời được táng tại làng Phú Xuân (Hương Trà, Thừa Thiên). Có một con trai.
  11. Nguyễn Phúc Đôn, làm tới chức Chưởng cơ. Có một con trai.
  12. Nguyễn Phúc Nghĩa, em cùng mẹ với chúa Thượng, chết non, không rõ giai thứ.

Con gái

  1. Nguyễn Phúc Ngọc Liên, chị cùng mẹ với chúa Thượng, tục gọi bà là Quận Thanh. Năm 1629, bà hạ giá lấy Trấn Biên dinh Lưu thủ Phó tướng Thanh Lộc hầu Mạc Cảnh Vinh (Nguyễn Phước Vinh), con trai Khai quốc công thần Mạc Cảnh Huống, hậu duệ của Mạc Đăng Dung.[38] Ông và bà lập ra hệ tính Nguyễn Hữu gốc Mạc, con cháu nay đổi họ Nguyễn Trường nhập tịch ở Quảng Nam. Ông bà sinh một con trai là Đội trưởng Toàn Trung hầu Nguyễn Phước Tao.
  2. Nguyễn Phúc Ngọc Vạn, em cùng mẹ với công nữ Ngọc Liên. Được gả làm Vương hậu của vua Chey Chetta II.
  3. Nguyễn Phúc Ngọc Khoa, em cùng mẹ với công nữ Ngọc Liên và Ngọc Vạn. Được gả làm Vương hậu của vua Chiêm Thành Po Rome.
  4. Nguyễn Phúc Ngọc Đỉnh (? - 1624), hạ giá lấy Nghĩa Quận công Nguyễn Cửu Kiều (1599-1656), con trai của Thượng tướng Nguyễn Quảng triều hậu Lê, bà sinh năm con trai: 1. Vỵ Xuyên hầu Nguyễn Cửu Thiên, 2. Duyên Lộc hầu Nguyễn Cửu Duyên, 3. Trấn Quận công Nguyễn Cửu Ứng, 4. Dực Đức hầu Nguyễn Cửu Kế, 5. Cẩm Long hầu Nguyễn Cửu Thân. Khi mất bà được ban thụy là Từ Thục. Ông và bà lập ra hệ tính Nguyễn Cửu.
  5. Nguyễn Phúc Ngọc Hoa: Con gái nuôi của chúa Sãi Nguyễn Phúc Nguyên, sau được gả cho Araki Soutaro (荒木宗太郎) của Nhật Bản. Câu chuyện về hai người trở thành một truyền kì nổi tiếng ở Nagasaki.